Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms