Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms