Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms