Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPNP63162 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms