Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms