Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms