Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VBP1P61758 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms