Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARF3P61204 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARF3P61204 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF3P61204 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms