Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms