Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms