Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms