Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms