Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA4P43694 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA4P43694 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms