Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms