Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN7P35236 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms