Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC13P31276 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms