Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms