Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms