Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms