Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms