Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO1P25800 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms