Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms