Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
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