Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1P21675 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1P21675 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1P21675 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1P21675 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms