Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCP20941 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCP20941 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCP20941 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCP20941 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms