Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms