Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSP20132 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSP20132 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms