Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms