Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEFHP12036 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEFHP12036 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEFHP12036 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEFHP12036 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEFHP12036 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms