Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DMDP11532 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DMDP11532 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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