Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GLI3P10071 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI3P10071 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI3P10071 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms