Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms