Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms