Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms