Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFLP07196 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms