Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APODP05090 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APODP05090 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APODP05090 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APODP05090 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APODP05090 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APODP05090 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APODP05090 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms