Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA17P01571 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA17P01571 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA17P01571 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms