Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD2O96028 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSD2O96028 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSD2O96028 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSD2O96028 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms