Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA3O96018 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA3O96018 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA3O96018 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
APBA3O96018 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA3O96018 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA3O96018 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA3O96018 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA3O96018 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA3O96018 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA3O96018 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA3O96018 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms