Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POP4O95707 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POP4O95707 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms