Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX4O95219 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX4O95219 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms