Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms