Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BBOX1O75936 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms