Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F6O75461 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms