Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP4O75379 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms