Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms