Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms