Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms