Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRICKLE3O43900 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms