Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGTAO43765 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGTAO43765 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms